Знамя Амурского казачьего войска, одобренное Геральдической комиссией по обеспечению деятельности казачьих обществ, внесённых в государственный реестр казачьих обществ в Российской федерации от 27.01.2006г. №1 (врученное Советником Президента по делам казачества героем России Г.Н.Трошевым 30.03.2006г.) представляет собой: прямоугольное полотнище, зеле­ного цвета, с жёлто-оранжевой каймой. Полотнище знамени и кайма обшиты серебристой тесьмой. По кайме полотнища вышиты серебристые восьмиконечные звезды – в углах по одной и на сторонах по две. По сторонам полотнища, в рамке в углах восьми лучевая звезда особого рисунка, по сторонам проходит серебристый плетеный узор особого рисунка.

На лицевой стороне полотнища знамени, двуглавый орел, под ним в зеленом поле плывущий влево казачий струг (золотая ладья) на синей волне. В верхней части рамки надпись АМУРСКОЕ, в нижней части рамки надпись КАЗАЧЬЕ ВОЙСКО. Надпись выполнена серебристыми буквами, стилизованными под старославянский шрифт.

На оборотной стороне полотнища, в центре «Спас не рукотворный». В верхней части рамки надпись ВЕРОЮ СПАСЁТСЯ, в нижней части рамки надпись РОССИЯ. 

На вершине – металлическое, золотое  прорезное копье с рельефным изображением Государственного герба Российской Федерации. 

.